自2019年EvanMacosko博士和FeiChen博士的学术实验室开发幻灯片测序以来,该技术因其易用性和高分辨率而引起轰动。GEN去年报道了几项应用该技术的研究,包括这项《自然》研究,该研究全面绘制了小鼠大脑中的细胞类型。利用空间和单基因组数据,科学家们识别出了大约90%的细胞群,包括中脑、脑桥、延髓和下丘脑内的细胞多样性区域。科学家们还利用该技术来研究涡虫和蝾螈等模式生物,并帮助建立参考图谱,绘制24种人体组织和器官(包括肺、皮肤、心脏和血液)的基因表达图谱。

Curio开始测试用于单细胞测序的商业空间条形码技术

Macosko和Chen等联合创始人于2021年推出了CurioBioscience,将载玻片测序商业化,并于2023年推出了他们的首款产品CurioSeeker。截至2023年11月,Curio声称有超过100家客户使用其技术。本周,Curio公布了扩大其产品组合的计划,宣布推出抢先体验计划(EAP),以测试其最新产品Trekker,这是其滑动标签技术的商业版本,也是由Chen和Macosko的实验室开发的,旨在将单细胞基因组学市场的空间数据。

Chen在2023年单细胞和人工智能医学研讨会(SCAIM23)的演讲中讨论了幻灯片标签。他将幻灯片标签描述为高通量单细胞基因组学和单核条形码的组合。2023年12月发表的另一篇《自然》论文中提供了更详细的描述,其中研究人员将幻灯片标签定义为一种策略,“其中完整组织切片内的单个核用源自具有已知位置的DNA条形码珠子的空间条形码寡核苷酸进行标记。这些标记的细胞核可以用作各种单核分析测定的输入。”此外,研究人员通过对大脑、扁桃体以及黑色素瘤细胞的样本进行分析,表明滑动标签可用于小鼠和人体组织。

研究人员写道,载玻片标签的一些优点是它与新鲜冷冻组织切片的兼容性,以及添加“空间解析数据而无需专门设备或牺牲数据质量”的能力。“该技术本质上以单细胞分辨率生成数据,无需反卷积和分割,并且具有高灵敏度。”其他优点包括同时分析多个组织切片、覆盖大组织切片的能力以及对单细胞和单核方法的适应性。

Curio已开始接受首批商业滑动标签套件的预订。该公司计划于今年春天正式推出Trekker。他们对其为单细胞测序领域增加价值的潜力感到乐观。

“单细胞测序对于分析细胞群来说是一种非常有影响力的技术,但研究界一直渴望了解感兴趣的细胞是如何在空间上组织的,因此我们着手开发一种能够实现这一点的方法,”Macosko说。也是布罗德研究所精神病学研究中心的研究员和马萨诸塞州总医院精神病学副教授。“CurioTrekker是这项工作的巅峰之作,它以一种易于访问的格式提供了单细胞研究人员目前所缺乏的空间背景。CurioBioscience使其易于使用,只需将其直接插入现有的基于单细胞的工作流程即可。”

Curio联合创始人兼首席技术官ChristinaFan博士补充道:“Curio正在为研究人员提供一个非常易于使用且功能强大的新工具,以一种对癌症生物学、神经科学、发育科学来说非常令人兴奋的方式推进发现研究,超越。我们相信CurioTrekker将给单细胞市场带来变革,因为它为科学家提供真正的单细胞空间分辨率,无论生物体或组织类型如何。”

EAP参与者之一、爱丁堡大学组织修复与再生主席、WellcomeTrust临床科学高级研究员NeilHenderson博士指出:“我们很高兴能够试用CurioTrekker空间测绘套件。我们标准单核RNA测序分析上游的一小时实验方案将极大地促进我们探究调节人类肝脏纤维化生态位的关键细胞和分子机制的能力。”